IllustratorのレイヤーとPhotoshopのレイヤーは微妙に感覚が異なります。

　基本的にIllustratorのレイヤーはPhotoshopのレイヤーと同じようにアートワークを重ねて配置するためにある機能ですが、レイヤーウインドウパネルではアートボード上のオブジェクトもそれぞれ個別にリスト表示されます。

　さらにグループ化された部分はその階層も含めた情報がレイヤーとして表示されます。

　レイヤー名部分をダブルクリックするとレイヤーオプションパネルが開きます。